Qualimap report: Genomic analysis

Input data and parameters

Liver

Path:

/home/fgarcia/Downloads/liver.counts

Liver

Path:

/home/fgarcia/Downloads/kidney.counts

Options

Threshold:	5
Species info:	/home/fgarcia/qualimapLatestBuild/qualimap-build-26-03-12/./species/human.61.genes.biotypes.txt

snRNA_boxplot.png

snoRNA_boxplot.png

unknown.png

miRNA.png

misc_RNA_boxplot.png

scRNA_pseudogene_boxplot.png

tRNA_pseudogene.png

pseudogene.png

scRNA_pseudogene.png

counts_boxplot.png

protein_coding.png

protein_coding_boxplot.png

IG.png

mitocondrial_boxplot.png

misc_RNA.png

TR_boxplot.png

miRNA_boxplot.png

GlobalSaturation.png

snRNA.png

processed_transcript_boxplot.png

TR.png

lincRNA_boxplot.png

IG_boxplot.png

processed_transcript.png

mitocondrial.png

lincRNA.png

rRNA.png

rRNA_boxplot.png

tRNA_pseudogene_boxplot.png

pseudogene_boxplot.png

DetectionPerGroup.png

unknown_boxplot.png

snoRNA.png

Input data and parameters

Liver

Liver

Options

snRNA_boxplot.png

snoRNA_boxplot.png

unknown.png

miRNA.png

misc_RNA_boxplot.png

scRNA_pseudogene_boxplot.png

tRNA_pseudogene.png

pseudogene.png

scRNA_pseudogene.png

counts_boxplot.png

protein_coding.png

protein_coding_boxplot.png

IG.png

mitocondrial_boxplot.png

misc_RNA.png

TR_boxplot.png

miRNA_boxplot.png

GlobalSaturation.png

snRNA.png

processed_transcript_boxplot.png

TR.png

lincRNA_boxplot.png

IG_boxplot.png

processed_transcript.png

mitocondrial.png

lincRNA.png

rRNA.png

rRNA_boxplot.png

tRNA_pseudogene_boxplot.png

pseudogene_boxplot.png

DetectionPerGroup.png

unknown_boxplot.png

snoRNA.png

Contents